В вашем .ini файле шлюза (cgi-bin\irbis64r_plus\irbis_server_ft.ini) испорчена нужная секция, из-за чего и возникает проблема.
В вашем файле секция присутствует в следующем виде:
[RDR_QUERY_CONSTRUCTOR]
FRAMES=C:\Apache24\cgi-bin\irbis64r_plus\frames_plus\Default\
ShowFrames=
SearchFrames=query_constructor_header.frm,RESULT,query_constructor_footer.frm,RecUpdateFrames=RESULT,rec_update_result_json.frm
DBNAME=RDR
тогда как должно быть:
[RDR_QUERY_CONSTRUCTOR]
FRAMES=C:\Apache24\cgi-bin\irbis64r_plus\frames_plus\Default\
ShowFrames=
SearchFrames=query_constructor_header.frm,RESULT,query_constructor_footer.frm
RecUpdateFrames=RESULT,rec_update_result_json.frm
DBNAME=RDR
Сомнительно, что вы могли получить .ini файл с такой ошибкой при поставке, поскольку тогда и другие пользователи столкнулись бы с подобными ошибками. А таких жалоб не было. Соответственно, предполагаю, что эта ошибка внесена у вас после установки. (Хотя если вы пишете, что ставили под IIS, и была та же ошибка, то непонятно, как это может быть.)
Такую ошибку сложно отловить отталкиваясь только от того, как она проявляется, а пользователю без достаточного опыта наверное и невозможно. Общий совет пользователям, который можно дать при разборе ошибок которые вдруг появились в процессе каких то настроек - проще всего отталкиваться от того, что вы правили, настраивая систему, и искать ошибку там. Для этого нужно иметь резервную копию, чтобы сравнить исходные файлы с измененными (например, Total Commander позволяет сравнить файлы и увидеть измененный кусок текста).