В ЦБС сводный каталог должен находиться только в Центральной библиотеке или и в библиотеках-филиалах тоже, при наличии в библиотеках-филиалах своих БД?

Скажите, а что Вы желаете услышать в ответ?
Если Вы сможете обеспечить доступ из филиалов к сводному ЭК в Центральной, то можно не копировать, а если не сможете, то копировать. А локальные БД в филиалах (которые нужны только в этих филиалах) определяются лишь настройками локальных версий ПО в этих филиалах.