В 64ом Ирбисе расширили справочник rzn.mnu и изменили лист подполя 47.wss в базе комплектования, но каким-то образом в "Прочие" разделы попадают несколько записей, т.е., если стоят новые значения - после 15 (16-23), то в подполе 47^x остается прежнее значение 6 (те записи, для значений раздела которых раньше не было подполей).
Как заполняется это подполе? Есть автоввод? Помогите, пожалуйста.

Того, что вы сделали, недостаточно. Статистику по разделам знаний задает файл rksu.fst. Если вы посмотрите, там есть строки для поля 47. А пока все новые разделы будут собираться в "Прочие".