Скажите пожалуйста, хранить ли записи в БД комплектования и как долго? Или же лучше периодически ее опустошать? Как вы поступаете. В отделе мнения разделились: одни говорят, что опустошать нельзя, другие, что не зачем хранить записи, ведь они переносятся в Ibis.

Не опустошать, а удалять записи БО, переданные в ЭК (например, по номеру КСУ), останутся запись Пользователя, записи организаций, подписка, все КСУ, записи БО партий, не переданных в ЭК.
Для удаления отмеченных записей специально подготовлено задание глобальной корректуры UDL