Здравствуйте!

ИРБИС17.1 (D2)

В суммарном отчете по дисциплинам некоторые учебники из ЭБС имеют странный ККО. Подскажите, пожалуйста, почему такое может быть?

А в чем странность? То что нет экземпляров, но ККО по книгам больше 0? Может среди книг есть электронные учебники и они дают ККК=1. Может данные в поле 693 устарели. Не забывайте, что " по книгам..." - это значит по полям 693, за которые отвечаете вы.
Проверьте эти данные. Т.е. в интерфейсе по данной дисциплине, направлению надо получить в нижнем окне список и выполнить формирование таблицы ККО. Возможно она покажет другие данные, тогда надо обновить поля 693.

ELS - БД учебников из ЭБС ("Лань" и др.) - все учебники электронные. Почему у них ККО не 1?

Во-первых, у вас таблица не только по ELS, а по IBIS+ELS.
Во-вторых, покажите эти 9 книг, как выглядит таблица ККО в интерфейсе для них. Выберите дисциплину, фильтр по направлению, внизу БД каталога и "Вычислить ККО"
Еще раз - счет выполняется по полям 693, вы можете посмотреть эти поля для этих 9-ти книг и сами найти среднее значение.