Исходите из того, что:
справочник ищется сначала в папке текущей БД. Если он там не находится, то ищется в deposit.
Если он д.б. единым, то из всех папок, кроме deposit, его надо удалить.

Как мне прикрепить справочник DISC.mnu К базе BGA поле 691 ^D ?

Прежде всего уточнить понятие "прикрепить справочник". Если справочник лежит в папке BGA или DEPOSIT, то он доступен для работы с БД.
Вы хотите использовать его при вводе наименования дисциплины? Это делается в рабочем листе вводе в колонке инструментов ввода. Но если вы вместо старого метода ввода сделаете ввод по справочнику, то вы лишите себя возможности вводить дисциплину вместе с контингентами, для которых она читается.
Надо уточнить вашу проблему. Вы работаете с АРМ КО? Или речь о вводе в АРМе Каталогизатор?

Спасибо за подсказку, я понял как с учебного плана КО вводить дисциплины.