Здраствуйте.
Можно ли как нибудь сохранить полный список предметных рубрик в тескстовый файл?

Можно.
1) выбрать из fst файла БД форматы отвечающие за формирование терминов словаря с префиксом S=, оформить их как файл и подключить к форме "статистика" через файл stt.mnu. После чего вывести статистику.
2) в ИРБИС 32 можно выгрузить список терминов словаря по определенному префиксу средствами ISIS или могу прислать независимую утилиту. Только здесь будет список именно ТЕРМИНОВ (верхний регистр, обрезка 32 символа)

Иркутская ОГУНБ
ИРБИС64.21Турбо
WebИРБИС-PHP

Добавил предметные рубрики в статистику. но почему то список выводиться только когда у записи галочку поставить. А отмечать 28 тыс. предметных рубрик как то проблематично :-)